Dr. Zaynab Shaik se navorsing fokus op die evolusie en diversifikasie van die Kaapse flora, en meer spesifiek die Kaapse papiermadeliefies, deur gebruik te maak van massief-parallelle gesekwensieerde DNS. Haar werk is integrerend en omvat taksonomiese navorsing, molekulêre filogenetika en filogenetiese metodesnavorsing. 

Haar PhD het gefokus op uitbreidings van die standaard multispesie-koalescentie soos geïmplementeer in Bayesiaanse filogenetiese metodes vir analitiese spesie-afbakening en filogenie-inferensie onder migrasie. Tydens haar nagraadse opleiding het sy die Beste MSc-praatjie-toekenning ontvang by die gesamentlike konferensie van die Suid-Afrikaanse Vereniging van Plantkundiges (SAAB) en die Suider-Afrikaanse Vereniging vir Sistematiese Biologie (SASSB) 2019, die Beste Jong Plantkundige-toekenning by die SAAB-konferensie 2020, en die Beste PhD-praatjie-toekenning by die SASSB-konferensie 2023.

Sy is 'n lid van die Nuwe Generasie Akademici-program (nGAP), 'n lid van die SASSB, SAAB, en die Vereniging vir Sistematiese Biologie, en 'n ontvanger van die Nilsson-Ehle Navorsingsfonds.